Eine kausale Therapie bzw. Heilung der MS ist bis heute nicht möglich. Die pathogenetisch definierten Ziele der kausal orientierten, immunprophylaktischen Therapie umfassen Beendigung der akuten entzündlichen Vorgänge, Wiederherstellung der Balance zwischen immunstimulierenden und -dämpfenden Mechanismen, langfristige Inaktivierung autoreaktiver T-Lymphozyten, Hemmung der gliösen Narbenbildung und Förderung der Remyelinisierung.
Klinisch unterscheidet man die Therapie des akuten Schubes mit dem Ziel, die Schubdauer abzukürzen, von einer langfristigen, prophylaktischen Therapie mit dem Ziel, die Schwere und Häufigkeit von Schüben zu verringern und das Ausmaß der fortschreitenden Behinderung günstig zu beeinflussen.